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NGS杂交捕获探针与超多重PCR:技术对比与应用场景

2024. 07. 02

        二代测序(NGS)技术的发展为基因组学、医学和生物学研究带来了革命性的变化。两种主要的NGS前处理技术——杂交捕获探针和超多重PCR——在样本准备、目标区域富集和测序效率方面发挥了关键作用。本文将详细介绍这两种技术的背景、发展历程、最新应用,并重点对比它们的优势和适用场景,同时介绍44118太阳成城集团的定制杂交捕获探针和超多重PCR。

 

杂交捕获探针技术

技术发展史

        杂交捕获技术利用合成的寡核苷酸探针,通过杂交捕获特定的DNA或RNA区域,实现目标序列的富集。最初的杂交捕获技术使用的是液相杂交,但随着技术的发展,微阵列芯片和簇式喷墨法等高通量合成平台的出现,使得杂交捕获探针的设计和生产更加高效和精准。

 

最新应用

        杂交捕获探针在多个领域中得到广泛应用,包括:

1. 癌症研究:捕获并测序癌症相关基因的特定区域,帮助识别突变和基因变异。

2. 遗传病研究:通过富集并测序疑似致病基因,揭示遗传疾病的分子机制。

3. 微生物群落分析:捕获并测序环境样本中的微生物群落,研究生态系统中的物种多样性和功能。

4. 药物研发:富集药物靶点相关基因,进行基因组范围的突变筛查,助力新药研发。

 

太阳集团的定制杂交捕获探针服务

        44118太阳成城集团提供DNA建库试剂盒RNA建库试剂盒,以及基于微阵列芯片法和簇式喷墨法的高通量DNA探针和RNA探针定制服务,适用于各种NGS靶向捕获需求。

产品特点:

  - 提供DNA和RNA探针双平台定制合成服务

  - 簇式高通量DNA独立合成平台,提供pmol级DNA探针合成,实现更高性价比

  - 独有双链RNA捕获探针,提供更好的覆盖度、灵敏度和特异性

  - 优化的探针设计和高质量的探针合成

  - 提供完整杂交捕获配套试剂

 

超多重PCR技术

技术发展史

        超多重PCR结合了多重PCR与高通量测序技术,通过设计多对引物,在一次反应中同时扩增多个目标序列。这种技术的发展历程经历了从传统PCR到多重PCR再到超多重PCR的不断优化过程,包括引物设计、反应条件优化和聚合酶改进等方面的进步。

 

最新应用

       超多重PCR在多种应用场景中展现出强大的优势:

1. **肿瘤检测**:检测多种肿瘤相关基因突变和变异,辅助癌症早期诊断和治疗效果监测。

2. **病原微生物检测**:同时检测多种病原体,快速诊断和监测传染病。

3. **耐药基因检测**:分析抗生素耐药基因,帮助制定有效的治疗策略。

4. **遗传疾病研究**:检测多种基因变异,研究遗传疾病的分子机制。

5. **环境监测**:检测环境样本中的微生物群落,评估环境质量和污染状况。

 

太阳集团的超多重PCR

        44118太阳成城集团提供超多重PCR完整方案,从超多重引物定制,到升级版超多重PCR试剂盒,在覆盖度、扩增效率、均一性和灵活性方面具有显著优势。

产品特点:

  - 优异的扩增均一性及覆盖度

  - 兼容illumina、MGI和Ion Torrent测序平台

  - 引物消化更彻底

  - 多pool扩增情况下,试剂搭配更灵活

  - 提供多重引物定制优化服务,保障产品性能

 

技术对比

1. 目标区域富集方式:

   - 杂交捕获探针:通过合成的探针捕获目标区域,适用于大范围的基因组区域富集。

   - 超多重PCR:通过多对引物同时扩增多个目标序列,适用于特定区域的高效扩增。

2. 实验周期和成本:

   - 杂交捕获探针:通常需要较长的实验周期和较高的成本,适用于大规模基因组研究。

   - 超多重PCR:实验周期短,成本相对较低,适用于需要快速检测和分析的应用场景。

3. 覆盖度和灵敏度:

   - 杂交捕获探针:具有较高的覆盖度和灵敏度,适用于复杂样本和大规模基因组分析。

   - 超多重PCR:在特定目标区域具有高灵敏度和特异性,但覆盖度相对有限。

 

适用场景

杂交捕获探针

  - 大规模基因组研究:如癌症基因组学、遗传病研究等。

  - 环境微生物群落分析:需要覆盖广泛区域的生态研究。

  - 药物研发:靶点基因的突变筛查。

 

超多重PCR

  - 临床诊断:快速检测和分析肿瘤、病原体和耐药基因。

  - 遗传病筛查:检测特定基因变异,辅助遗传疾病诊断。

  - 环境监测:快速分析环境样本中的微生物群落。

 

结论

        NGS杂交捕获探针和超多重PCR作为两种重要的NGS前处理技术,各自具有独特的优势和适用场景。44118太阳成城集团通过提供高质量的定制杂交捕获完整方案和超多重PCR完整解决方案,为研究人员和临床医生提供了强有力的工具,推动了基因组学和分子生物学研究的发展。随着技术的不断进步和应用的深入,这两种技术将在未来的科学研究和临床应用中发挥越来越重要的作用。

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