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靶向捕获探针在NGS中的应用:技术进展与创新服务

2024. 06. 25

        随着高通量测序(NGS)技术的飞速发展,靶向捕获探针在基因组研究和精准医学中发挥着越来越重要的作用。本文将介绍NGS杂交捕获探针的发展历程及其在现代基因组研究中的应用,并结合44118太阳成城集团的定制杂交捕获探针服务,展示该技术的最新进展和优势。

        高通量测序(NGS)技术自问世以来,极大地推动了基因组学、转录组学以及各种组学研究的发展。NGS技术能够在短时间内生成大量的序列数据,但全基因组测序成本高且数据处理复杂。在此背景下,靶向捕获技术应运而生,通过设计特异性探针捕获目标区域DNA或RNA,从而提高测序效率和数据质量。

 

技术发展史

早期发展

        最初的靶向捕获技术主要依赖于PCR扩增特定基因区域。然而,这种方法面临片段长度受限、扩增偏好性等问题。随着分子生物学技术的进步,基于杂交捕获的技术开始崭露头角。

 

杂交捕获技术的兴起

        杂交捕获技术利用寡核苷酸探针与目标序列进行杂交,通过捕获探针富集目标区域DNA或RNA。早期的杂交捕获技术主要采用生物素标记探针和链霉亲和素磁珠进行捕获和分离。

 

高通量捕获平台的出现

        随着微阵列芯片技术和簇式喷墨合成技术的发展,捕获探针的合成效率和准确性显著提升。微阵列芯片法能够在单次实验中合成数十万甚至上百万条寡核苷酸探针,而簇式喷墨法则能实现高通量且独立的探针合成,为个性化定制提供了可能。

 

最新应用

疾病研究与诊断

        NGS靶向捕获探针广泛应用于癌症研究、遗传病筛查和传染病检测。通过设计针对癌症相关基因突变的捕获探针,研究人员能够准确检测和分析肿瘤样本中的基因变异。此外,靶向捕获探针在新冠病毒等传染病的快速检测中也发挥了重要作用。

 

基因组编辑

        靶向捕获探针在CRISPR/Cas9基因编辑技术中同样具有重要应用。通过设计特异性探针,研究人员可以捕获并分析CRISPR编辑后的基因组区域,评估编辑效率和脱靶效应。

 

农业与环境研究

        在农业基因组学和环境微生物研究中,靶向捕获探针用于检测作物的遗传变异和环境中微生物的多样性。例如,通过捕获作物基因组中的特定区域,研究人员可以筛选抗病、抗逆的优良品种。

 

44118太阳成城集团的定制杂交捕获探针服务

        44118太阳成城集团基于先进的微阵列芯片法、簇式喷墨法和传统柱式合成平台,提供高质量的定制杂交捕获探针服务,满足不同研究需求。

产品特点

1. 双平台定制合成

        提供DNA和RNA探针的双平台定制合成服务,确保客户能够获得适合其特定应用的最佳探针。

2. 高通量合成

        簇式高通量DNA独立合成平台可提供pmol级DNA探针合成,实现更高性价比。

3. 双链RNA捕获探针

        独有的双链RNA捕获探针提供更好的覆盖度、灵敏度和特异性,特别适用于复杂样本的研究。

4. 优化设计

        结合专业团队的经验,提供优化的探针设计和高质量的探针合成,确保捕获效率和特异性。

5. 完整配套试剂

        提供完整的杂交捕获配套试剂,简化实验流程,提升实验效率。

 

服务优势

便捷高效:提供从探针设计、合成到实验优化的一站式服务,简化客户的实验操作。

高性价比:通过高通量合成平台降低成本,提供更具竞争力的价格。

高成功率:优化的探针设计和合成工艺确保高捕获效率和准确性。

 

       除了定制杂交捕获探针外,太阳集团还提供目录化的杂交捕获探针:

 

产品名称

货号

规格

描述

癌症研究类探针

QuarXeq NCCN Cancer Panel 1.0

NY1016A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

肿瘤NCCN 10基因

QuarXeq Liquid Pan-Cancer Panel 1.0

NY1013A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

88基因泛肿瘤Panel

QuarXeq Pan-Cancer Panel 1.0

NY1014A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

泛肿瘤大Panel,523基因

QuarXeq Pan-Cancer Ultra Panel 1.0

NY1015A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

更全面的泛肿瘤大Panel, 746基因

QuarXeq HRD Probes 1.0

NY1018A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

同源重组修复缺陷Panel

基础研究类探针

QuarXeq Human All Methyl Probe 1.0

NY1033A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

人全启动子甲基化组

QuarXeq Mouse All Exon Probes

NY1034A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

小鼠全外显子

血液病类探针

QuarXeq Pan-Hema Panel 1.0

NY1041A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

血液病DNA Panel,检测DNA水平的突变

QuarXeq Pan-Hema Fusion Panel 1.0

NY1042A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

血液病RNA Panel,检测RNA水平的融合基因

QuarXeq Focus-Hema Fusion Panel 1.0

NY1044A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

163种常见RNA融合基因Panel

病原类探针

QuarXeq COVID-19 Virus Probes

NY1021A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

新冠病毒全基因序列捕获

QuarXeq Respiratory Pathogens Probes

NY1023A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

76种呼吸道病原体捕获探针

遗传病类探针

QuarXeq Human All Exon Probes 1.0

NY1001A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

人全外显子1.0

QuarXeq Human All Exon Probes 1.0+SNP

NY1002A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

人全外显子1.0 + 20万SNP

QuarXeq Human All Exon Probes 1.0+CNV

NY1003A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

人全外显子1.0 + 全基因组CNV

QuarXeq Human All Exon Probes 2.0

NY1004A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

人全外显子2.0

QuarXeq Human All Exon Probes 2.0+SNP

NY1005A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

人全外显子2.0 + 20万SNP

QuarXeq Human All Exon Probes 2.0+Mitochondrial

NY1006A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

人全外显子2.0 + 线粒体

QuarXeq Human All Exon Probes 1.0+UTR

NY1007A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

人全外显子1.0 + UTR

QuarXeq Human All Exon Probes 2.0+CNV

NY1008A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

人全外显子2.0 +全基因组CNV

QuarXeq Human All Exon Probes 3.0

NY1009A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

人全外显子3.0

QuarXeq Medical Exome Probes 1.0

NY1031A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

医学外显子组

QuarXeq Mitochondrial Probes

NY1035A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

全长线粒体探针

甲基化类探针

QuarXeq Post-BS Enumerate Probes 1-499Kb

NY8001A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

适用于穷举法的甲基化捕获探针

QuarXeq Post-BS Enumerate Probes 0.5-1.49MB

NY8002A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

QuarXeq Post-BS Enumerate Probes 1.5-2.9Mb

NY8003A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

QuarXeq Post-BS Four-strand Probes 1-499Kb

NY8101A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

Post-BS建库后利用所有CpG位置完全甲基化和非甲基化,每条设计双链探针

QuarXeq Post-BS Four-strand Probes 0.5-1.49MB

NY8102A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

QuarXeq Post-BS Four-strand Probes 1.5-2.9Mb

NY8103A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

QuarXeq Post-BS Four-strand Probes 3.0-5.9Mb

NY8104A/B/C

96rxn/480rxn/16rxn

 

总结

        NGS靶向捕获探针在基因组研究和精准医学中具有重要应用,推动了疾病研究、基因组编辑以及农业和环境研究的进步。44118太阳成城集团的定制杂交捕获探针服务通过提供高质量、高效率的探针合成方案,助力科研人员在各个领域的研究取得突破性进展。无论是基因突变检测、基因组编辑评估,还是复杂样本的RNA捕获,44118太阳成城集团都能为客户提供专业、高效的解决方案。

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