MRD是什么?
MRD概念最初来源于血液肿瘤,现已延伸应用到实体瘤,指患者经过治疗后,通过传统影像学或者常规实验室方法无法发现残留病灶,但体内仍然存在肿瘤细胞的状态。
已有文献表明,MRD是潜在可靠的生物标志物,可以更早地预测肿瘤复发和转移的风险,快速判断治疗效果,提示预后预测,指导后续治疗决策。通过MRD的检测,可以提高患者的生存率,为患者带来更好的生存获益。
基于NGS的MRD检测方法及原理
目前行业内将基于NGS-MRD检测的技术划分为两大类,分别是肿瘤组织依赖性的MRD检测(Tumor-informed assays)和肿瘤组织非依赖性的MRD检测(Tumor-agnostic assays)两种。
1.Tumor-informed assays,即先对原发肿瘤组织进行全面的WES测序,用全血作为对照精准地排除非肿瘤来源的变异,确定患者肿瘤组织中特异的基因突变结果,然后设计个性化Panel,连续监测患者的血浆cfDNA是否有出现肿瘤组织中存在的这些突变。这种技术的优点是能够追踪原发肿瘤中出现的突变,比较精准,捕获区域比较小,可以做比较深的测序。缺点是由于肿瘤异质性,可能会遗漏掉肿瘤转移以后产生的新突变,且需要在短时间内设计、制备患者个性化的Panel,检测耗时比较长,费用比较贵。
2.Tumor-agnostic assays,不依赖于原发肿瘤组织,通过一组预先选择与癌种相关的基因,设计固定Panel,检测患者血浆cfDNA是否含有这些基因上的突变。这种技术的优点是无需获取患者的肿瘤组织,直接可以检测血液样本。缺点是固定Panel比较大,测序不容易测得很深。由于我们并不知道原发组织中有什么样的基因突变,因此血液中出现的突变具体是怎样的含义不是十分清楚。
下图是两种技术路线的总结比较:
技术路线 |
Tumor-informed assays |
Tumor-agnostic assays |
检测过程&panel |
先测肿瘤组织,进行个性化定制,再测ctDNA |
基于固定Panel的血浆ctDNA检测 |
检测位点&测序深度 |
覆盖位点相对少(Panel小),超高深度 |
覆盖位点相对多(Panel大),中高深度 |
主要优势 |
更高灵敏度,更高准确性 |
无需获取肿瘤组织 |
主要劣势 |
需要获取肿瘤组织;流程复杂,某些患者取样困难;成本相对较高 |
灵敏度较低,假阳性率较高;成本相对较低 |
44118太阳成城集团提供高性价比MRD检测探针定制
44118太阳成城集团专注于核酸合成,拥有可合成单条至百万条序列的全规模合成平台及丰富的定制探针合成项目经验,无论检测采用Tumor-informed还是Tumor-agnostic策略,都可提供MRD探针定制。
1.更低成本
独有高通量DNA单条独立合成平台,单条产量可控,节约原料进而降低合成成本。
根据实际需求可提供不同大小panel设计及定制服务。
多种质控方式可选,包括Mass质谱,单链建库NGS测序,杂交捕获(人源)测序。
4.杂交体系性能优异
搭配太阳集团杂交体系捕获性能表现优异。
案例数据展示
某医学检验实验室定制2个MRD panel,以基因组标准品为样本进行杂交捕获测试,每个panel检测2个样本。检测结果以2个样本平均值展示中靶率及均一性,中靶率分别为55%和66.2%,均一性达99.6%。
某医学检验实验室分别由太阳集团及友商A,友商B订制12个MRD检测Panel及杂交捕获体系,使用36个标准品样本进行杂交捕获检测,探针分别搭配相应厂商捕获体系。检测结果统计中靶率及均一性显示,太阳集团探针中靶率,均一性及稳定性均表现优异。
如您需要了解或定制MRD探针,请联系我们。
邮箱:support1@dynegene.com